Das Städtenetz Soziale Stadt NRW ist angebunden an den Städtetag Nordrhein-Westfalen. Als bundesweit tätige Einrichtung zählt das Deutsche Institut für Urbanistik (difu) zu den Partnern. Ebenso besteht ein regelmäßiger Kontakt zu den Landesministerien, speziell dem federführenden Ministerium für Heimat, Kommunales, Bau und Gleichstellung des Landes Nordrhein-Westfalen (MHKBG NRW) sowie zu den Bezirksregierungen in NRW.
Eine im April 2003 unterzeichnete Kooperationsvereinbarung zwischen dem federführenden Ministerium und dem Städtenetz Soziale Stadt NRW bildet die Basis der gemeinsamen Arbeit.
Zwei Sprecher vertreten das Städtenetz Soziale Stadt NRW nach außen.
Der Beirat, der aus Vertretern der Städte gebildet wird, regelt die grundsätzlichen Fragen der Zusammenarbeit, der Mittelverwendung sowie des Arbeitsprogramms.